Главная


Тормозит http://computersclub.ru/viewtopic.php?t=577 - ComputersClub.ru

Сайт-специфическая рекомбинация

При сравнении нуклеотидных последовательностей клонов гаметных генов V и С можно точно указать сайт, в котором произошло соединение гаметных генов V и J1 в лимфоидных клетках, давших начало МОРС41.

Участок рекомбинации V — J гена и МОРС41.

Последовательность перестроенного и экспрессирующегося гена МОРС41 приведена вместе с последовательностью гаметного предшественника F-области (эмбриональный VK41)
и гаметного предшественника J-области (эмбриональный J — С). Вертикальные линии между двумя последовательностями отмечают
идентичные нуклеотиды и указывают на гаметный источник рекомбинировавшей последовательности. 5'-область перестроенного гена (слева) идентична гаметному
предшественнику до второго нуклеотида кодона 95. Начиная с этой точки, перестроенный ген совпадает с предшественником J-области. Такое сравнение позволяет
точно локализовать участок перехода (точку перекреста). Горизонтальными черточками отмечены палиндромный гептамер CACAGTG в гене F и
комплементарный ему CACTGTG в гене J. Эти элементы, как считают, принимают участие в рекомбинации.

Как видно из рисунке, перестроенный клон совпадает с гаметным клоном V до второго нуклеотида кодона 95; очевидно также, что перестроенная последовательность после этой точки происходит уже из Л. Всегда ли рекомбинация происходит точно между вторым и третьим нуклеотидами кодона 95?

Анализ аминокислотных последовательностей х-цепей позволяет предположить, что, напротив, система рекомбинации обладает некоторой гибкостью. Выше уже было отмечено, что аминокислотные последовательности всех х-цепей с известной первичной структурой соответствуют тому или иному гаметному J-сегменту в области 97—108. Существуют, однако, х-цепи, у которых амино-кислота-96 не соответствует ни одному из гаметных J-фрагментов. Эти цепи могли бы кодироваться теми перестроенными генами, у которых соединение между V- и J-фрагментами произошло между разными нуклеотидами внутри кодона 96.

Гибкость рекомбинационной рамки может объяснить вариабельность в кодоне 96.

Первый пример иллюстрирует участок рекомбинации в МОРС41 — между вторым и третьим нуклеотидами кодона 95.
Второй случай — соединение между кодонами 95 и 96 — приводит только к молчащей замене третьего основания кодона 95
(без замены аминокислоты). В третьем случае, при рекомбинации внутри кодона 96, TGG (Тгр) изменяется на CGG (Arg).
В четвертом случае кодон 96 превращается в CCG (Pro).

Это наблюдение может объяснить необычайно высокую вариабельность аминокислот в положении 96. Сравнение перестроенной и гаметной форм других генов также позволяет предположить, что точки рекомбинации в них обладают некоторой подвижностью.